在五年前的《不义联盟2》的背景下，小丑骗超人杀了他的妻子和胎儿，炸毁了这座城市。在悲伤中，超人杀死了小丑。一天之内，世界上最伟大、最崇高的人从英雄变成了杀人犯。由于英雄自称的收入而失去了太多的生命。它永远不会杀死一个罪犯。
蝙蝠侠无数次抓住小丑，但每次都救了他的命。眼见小丑再次越狱，他终于造成了这场屠杀。如果法律不能惩罚罪犯，就让权力创造和平。让钢铁超人做出唯一的决定，因为法律在凡人的统治下无所作为。
1、世界上最好的合作伙伴
破坏Crypton的幕后黑手，游戏的新boss布里尼亚克发现了超人的存在。
为了更好地管理创伤后的地球，蝙蝠侠创建了兄弟之眼系统作为全球监视和通信中心，这是现在布里尼亚克入侵的最佳起点。
12级智慧给了布拉尼亚克足够的耐心。经过几天的侵蚀，兄弟俩下线的那一刻，布拉尼亚克的机械大军就降落在了地球上。收获开始于每一个角落。
蝙蝠侠有足够的时间来计划每场比赛，但布拉尼亚克的军队每分每秒都在屠杀地球上的无辜人民。
在关键时刻，他想出了一个危险而激动人心的计划。
他需要超人的力量。
超人从没想过要伤害地球。事实上，他从未想过伤害一个无辜的人。
他亲手杀了很多好人，但这些都是他正确统治的障碍。他想做的就是以自己的方式保护地球。
当蝙蝠侠选择从牢房中释放出来时，他知道情况严重到世界上最聪明的人无能为力。地球现在需要他们中的两个重新加入，地球需要世界上最好的伙伴。
超人带着蝙蝠侠登上了布拉尼亚克飞船。没有机械军的保护，布拉尼亚克的力量也开始消退，这给了超人打败他的机会。
击倒后，蝙蝠侠彻底切断了布拉尼亚克与外界的联系，明显削弱了布拉尼亚克，击败了他。
在消灭了最大的敌人之后，是时候解决彼此的不满了。
2、最好的搭档也是最强的敌人
如果玩家在最后一章选择超人，就会进入超人结局。超人将与蝙蝠侠营地的绿灯侠赫尔、弗莱士伯里和超女角色对战。
超人的能力还没有完全恢复，但在绝对的力量面前，三人依旧是败下阵来。现在，超人政府的复活只有一个障碍——蝙蝠侠。
此时，蝙蝠侠穿着最强的套装，Crypton的战甲。他和超人每一次出拳，都突破音障，震撼整个星球。这可能是凡人离上帝最近的一次——不幸的是，这只是一次。
当蝙蝠侠用尽最后的力量时，超人还站在那里。
“说不定你几年前杀了你，事情会容易很多。”
一只手举起超人蝙蝠侠就像手里拿着一只虫子——世界上最强的虫子，但仍然只是一只虫子。可就在他准备用火辣辣的眼睛灼烧蝙蝠侠的脑袋时，他又停了下来。
“如果你现在杀了你，你就是烈士。不，我要让你活着。”
在这里玩耍的小鹦鹉，已经感觉到了某种不一样的情绪在两人之间流动。
如果玩家在最终章选择了蝙蝠侠，就会进入蝙蝠侠的结局。蝙蝠侠将在超人营地对抗黑亚当、海王和神奇女侠。
在超人还在狱中的时候，蝙蝠侠准备了23个对付超人的方案，但目前剩下的选择并不多。蝙蝠侠身披氪石铠甲，但凭借着强化的身体和氪石，想要打败真正的世界之神，依然不是一件容易的事。
但他是蝙蝠侠。
战斗并不容易。 Kryptonite Battle Gear可以保护蝙蝠侠并削弱超人，但它确实是帮助蝙蝠侠获胜的仍然是战斗技巧和对正义的信念。
超人耗尽了最后的力量，倒在了地上。蝙蝠侠也跪下想着这场来之不易的胜利。
3、结尾
所有的恶棍都是他自己故事中的英雄。蝙蝠侠和超人都是人心目中的英雄，在面对罪犯时，他们保持利润，不伤生命。
他们赋予他们在危机时期执法的权力，但永远没有定罪的权利。直到超人杀死小丑。
当世界上最有权势的两个人的信仰相互矛盾时，一场战争就爆发了。或许，这个世界上根本就没有“好人”和“坏人”之分。
不过好在最后两个结局，他们都如愿以偿。超人有一个完全受保护但可怕的地球。
随着对权力的渴望越来越强烈，他再次转向了整个宇宙。蝙蝠侠依然固守利润，并没有用双手沾满无数鲜血杀死超人。但代价是最大的威胁仍然存在。游戏《不义联盟2》的剧情可以说是永不落幕的电影。这篇文章只是整个概要的一小部分，只介绍了两个主要人物。对整个故事感兴趣的玩家或英雄战斗可能希望从两者开始。这款游戏感受到了它独特的魅力。